Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CTSVO60911 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CTSVO60911 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CTSVO60911 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms