Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRAMEF4O60810 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PRAMEF4O60810 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms