Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MARCH6O60337 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms