Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HTATSF1O43719 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HTATSF1O43719 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms