Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRC1O43663 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRC1O43663 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRC1O43663 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRC1O43663 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRC1O43663 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRC1O43663 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRC1O43663 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRC1O43663 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRC1O43663 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms