Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DENRO43583 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DENRO43583 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DENRO43583 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DENRO43583 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms