Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PHF1O43189 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PHF1O43189 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms