Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CLOCKO15516 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CLOCKO15516 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms