Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
APAF1O14727 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
APAF1O14727 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
APAF1O14727 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
APAF1O14727 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms