Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLRMTO00411 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
POLRMTO00411 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms