Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
APOC4-APOC2K7ER74 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms