Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PATL2C9JE40 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PATL2C9JE40 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms