Protein–RNA interactions for Protein: B4DSR2

cDNA FLJ52234, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DSR2 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
B4DSR2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
B4DSR2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B4DSR2 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B4DSR2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms