Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CENPBD1B2RD01 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms