Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC169A6NNP5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC169A6NNP5 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms