Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XIRP2A4UGR9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
XIRP2A4UGR9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms