Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A4Q9Y6R1 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A4Q9Y6R1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms