Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H8

GJA3, Gap junction alpha-3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA3Q9Y6H8 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJA3Q9Y6H8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJA3Q9Y6H8 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms