Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
HDGFL3Q9Y3E1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HDGFL3Q9Y3E1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms