Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TPRKBQ9Y3C4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms