Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMED7Q9Y3B3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TMED7Q9Y3B3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms