Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LEMD3Q9Y2U8 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LEMD3Q9Y2U8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms