Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TRAPPC8Q9Y2L5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TRAPPC8Q9Y2L5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms