Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SBNO2Q9Y2G9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SBNO2Q9Y2G9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms