Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RCE1Q9Y256 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms