Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THSD7AQ9UPZ6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms