Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HPS5Q9UPZ3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms