Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms