Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PHF8Q9UPP1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PHF8Q9UPP1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms