Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SNX6Q9UNH7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SNX6Q9UNH7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms