Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TRAPPC2LQ9UL33 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRAPPC2LQ9UL33 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms