Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MYH13Q9UKX3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYH13Q9UKX3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms