Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
GJD2Q9UKL4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GJD2Q9UKL4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms