Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MRTO4Q9UKD2 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms