Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SWAP70Q9UH65 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SWAP70Q9UH65 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms