Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ABCF2Q9UG63 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCF2Q9UG63 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms