Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EPHA6Q9UF33 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms