Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CFDP1Q9UEE9 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CFDP1Q9UEE9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms