Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
DKK3Q9UBP4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
DKK3Q9UBP4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms