Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
XCL2Q9UBD3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms