Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL42Q9P2K6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms