Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RRBP1Q9P2E9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RRBP1Q9P2E9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms