Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CHPF2Q9P2E5 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CHPF2Q9P2E5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms