Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PODXL2Q9NZ53 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms