Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMOD3Q9NYL9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMOD3Q9NYL9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms