Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CENPMQ9NSP4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CENPMQ9NSP4 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms