Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TM7SF3Q9NS93 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TM7SF3Q9NS93 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms