Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RTN4Q9NQC3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTN4Q9NQC3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms