Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLMPQ9H6B4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLMPQ9H6B4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms