Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EHD4Q9H223 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EHD4Q9H223 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms